Szerkezeti bioinformatika

Szerkezeti bioinformatika

2006/07. tanév, I. félév

Gáspári Zoltán, ELTE Szerves Kémiai Tanszék

Az anyagokat helyhiány miatt levettem a szerverrõl (az alábbi linkek inaktívak), azokat a kurzus hallgatóinak kérésre e-mailen elküldöm.

Tematika és az órák anyagai

  1. A Protein Data Bank adatbázis felépítése és használata
  2. Kísérletileg meghatározott szerkezetek minõségének elemzése
  3. Másodlagos szerkezeti elemek hozzárendelése
  4. Térszerkezetek osztályozásának alapjai, hierarchikus adatbázisok
  5. Fehérjeszerkezetek összehasonlítása, algoritmusok és alkalmazások
  6. Szerkezeti domének azonosítása
  7. Szerkezet-funkció hozzárendelések
  8. Funkcionálisan fontos aminosavak azonosítása
  9. Aminosav-aminosav kölcsönhatás-hálózatok fehérjékben
  10. Nukleinsavak szerkezetének elemzése
  11. Bevezetés a fehérjeszerkezet-jóslásba
Javasolt irodalom: P.E. Bourne és H. Weissig (szerk.): Structural Bioinformatics. Wiley-Liss, 2003.