Nyitólap
Oktatás
Munkatársak
Kutatás
Alapítványok
Egyebek

ELTE-MTA Fehérjemodellező Kutatócsoport

ELTE-MTA Peptidkémiai Kutatócsoport

Gáspári Zoltán: Szerkezeti bioinformatika
(előadás és számítógépes gyakorlat)

(ETR: bbbn1b15/1 és bbbn2b02/1)

A kurzus célja az elsősorban már szerkezeti biokémiai alapismeretekkel rendelkező hallgatók megismertetése a biomolekuláris térszerkezetek elemzésének, értékelésének és osztályozásának módszereivel, problémáival. Ajánlott mindenkinek, aki komolyan érdeklődik a biomolekulák atomi szintű térszerkezete és az abból kikövetkeztethető információk iránt.
Az előadás a gyakorlat nélkül, önállóan is felvehető.
Tematika
  1. A Protein Data Bank adatbázis felépítése és használata
  2. Kísérletileg meghatározott szerkezetek minőségének elemzése
  3. Másodlagos szerkezeti elemek hozzárendelése
  4. Szerkezeti domének azonosítása
  5. Térszerkezetek osztályozásának alapjai, hierarchikus adatbázisok
  6. Fehérjeszerkezetek összehasonlítása, algoritmusok és alkalmazások
  7. Szerkezet-funkció hozzárendelések
  8. Funkcionálisan fontos aminosavak azonosítása
  9. Aminosav-aminosav kölcsönhatás-hálózatok fehérjékben
  10. Bevezetés a fehérje-szerkezet-jóslásba
  11. Nukleinsavak szerkezetének elemzése
A kurzushoz készült segédanyagok a tárgyat felvett hallgatók számára elérhetőek az elearning.elte.hu (moodle) oldalon pdf formátumban. A PDF formátumú segédanyagok olvasásához az ingyen letölthető Adobe Readert ajánljuk.

Vissza az előadások listájához